Aspergillus spp.
Les espèces Aspergillus spp sont des champignons filamenteux formant des spores (c’est-à-dire des conidies) appartenant à la famille des Trichocomaceae. Le genre Aspergillus comprend de nombreuses espèces, dont certaines sont bien connues et considérées comme des agents pathogènes opportunistes importants dans les établissements de santé, telles que A. fumigatus, A. niger, A. flavus, A. terreus, A. nidulans et A. clavatus [1]. Aspergillus fumigatus est la cause la plus fréquente d’infections pulmonaires invasives, tandis qu’Aspergillus flavus est plus souvent associé à des infections extrapulmonaires invasives. L’aspergillose peut se présenter sous des formes nombreuses, mais rares. Elle est principalement observée chez les patients immunodéprimés. Le système pulmonaire et le tube digestif sont respectivement les sites primaires et secondaires de l’aspergillose invasive. L’aspergillose intestinale ayant un taux de mortalité de 39 %, la prévention est un facteur clé de réduction des risques pour les patients.
Pertinence du pathogène pour la transmission en endoscopie
Gastroentérologie : moyenne à haute
Pneumologie : Haute
Oto-rhino-laryngologie : Haute
Urologie : Haute
Pertinence d’une surveillance endoscopique
Organisme modérément à hautement préoccupant
Selon les espèces, car la grande majorité des espèces appartenant au genre Aspergillus sont d’origine environnementale et souvent inoffensives pour les personnes immunocompétentes.
Aspergillus peut se présenter comme un contaminant environnemental provenant de l’air ou de l’eau et a été identifié dans la littérature comme ayant contaminé les systèmes de traitement de l’eau qui alimentent les dispositifs de traitement automatisés (p. ex. les AER/EWD) [4].
Les travaux de construction, d’aménagement paysager et de rénovation des installations dispersent des spores fongiques dans l’air, ce qui peut entraîner une contamination persistante des systèmes de circulation d’air.
La détection d’Aspergillus d’origine environnementale lors de la surveillance microbienne peut entraîner de fausses épidémies et potentiellement dégénérer en problèmes de sécurité des patients.
Mode de transmission
Le réservoir naturel est le sol et la rhizosphère des plantes.
Modes de transmission : contact direct via des instruments médicaux contaminés (par exemple, instruments chirurgicaux, dispositifs médicaux placés dans les vaisseaux sanguins ou le cœur) ; inhalation de conidies (spores) [5].
Résistance aux antifongiques
Il est cliniquement reconnu qu’A. fumigatus a la capacité de développer une résistance aux médicaments à base d'azole [5][6].
Au-delà d’A. fumigatus, des recherches scientifiques récentes révèlent que de nombreuses autres souches commencent également à développer une résistance aux antifongiques [7].
Exemple : méthode de culture
En règle générale, on utilise du SDA (gélose de Sabouraud dextrose) ou du PDA (gélose à la pomme de terre et au dextrose) comme milieu de culture, et l’incubation est effectuée à une température comprise entre 35 et 37 °C ou entre 25 et 30 °C, selon l’espèce cible. Bien que de nombreuses espèces d’Aspergillus spp. puissent se développer en trois jours, il est important de noter que les espèces fongiques peuvent souvent nécessiter une période plus longue pour que leur croissance soit observable. Il convient d’accorder une attention particulière à ces variations dans le temps de croissance, car des périodes de croissance prolongées sont nécessaires par rapport à l’incubation bactérienne traditionnelle.
Sources et lectures complémentaires
Yelika, Suresh Baba et al. “Intestinal Aspergillosis: Systematic Review on Patterns of Clinical Presentation and Management.” Surgical infections vol. 22,3 (2021): 326-333. doi:10.1089/sur.2020.157.
De Francesco MA. Drug-Resistant Aspergillus spp.: A Literature Review of Its Resistance Mechanisms and Its Prevalence in Europe. Pathogens. 2023 Oct 31;12(11):1305. doi: 10.3390/pathogens12111305. PMID: 38003770; PMCID: PMC10674884.
Djenontin, Elie et al. “Antifungal Resistance in Non-fumigatus Aspergillus Species.” Mycoses vol. 68,4 (2025): e70051. doi:10.1111/myc.70051.
Khalsa K, Smith A, Morrison P, Shaw D, Peat M, Howard P, Hamilton K, Stewart A. Contamination of a purified water system by Aspergillus fumigatus in a new endoscopy reprocessing unit. Am J Infect Control. 2014. https://doi.org/10.1016/j.ajic.2014.08.008. Consulté en juillet 2025.
CDC. "Antimicrobial-Resistant Aspergillus." Public Health: Aspergillosis, 24 Apr. 2024, www.cdc.gov/aspergillosis/php/guidance/index.html. Accessed June 2025.
Garvey, Mary et al. “Efficacy of cleaning, disinfection, and sterilization modalities for addressing infectious drug-resistant fungi: a review.” Journal of applied microbiology vol. 136,1 (2025): lxaf005. doi:10.1093/jambio/lxaf005.
World Health Organization. “Fungal Priority Pathogens List to Guide Research, Development and Public Health Action.” World Health Organization, 2022. https://www.who.int/publications/i/item/9789240060241. Consulté en juillet 2025.