Micrococcus luteus

Micrococcus luteus est une bactérie Gram-positive, sphérique (coque), non fermentante, appartenant à la famille Micrococcaceae. Selon les conditions de croissance, M. luteus peut se présenter sous forme de boules isolées, par paires (diplocoques), en tétrades (groupes de quatre) et même en grappes irrégulières. Étant une espèce aérobie obligatoire, on la trouve très couramment dans le microbiote cutané et les muqueuses des animaux, dans l’environnement (sol et eau) ainsi que sur des surfaces abiotiques telles que la poussière. Pour cette raison, il est extrêmement courant de retrouver cette espèce dans les environnements cliniques. Elle fait partie des contaminants les plus fréquemment identifiés lors des contrôles de routine effectués dans les salles blanches.

Le genre Micrococcus ne comprend actuellement que quelques espèces, car les techniques moléculaires modernes ont permis de reclasser de nombreux organismes qui étaient auparavant classés à tort dans ce genre, dont Micrococcus luteus est l’espèce type. Micrococcus est généralement considéré comme non pathogène dans la plupart des cas, bien que des caractéristiques parasitaires puissent apparaître dans certaines situations particulières, notamment chez les patients immunodéprimés, souvent sous l’influence de l’environnement, des facteurs de risque de l’hôte et des interventions médicales (par exemple, la présence d’un cathéter à demeure non hygiénique).

M. luteus n’est pas capable de former une endospore épaisse pour se protéger des environnements hostiles. Cependant, M. luteus peut former des biofilms, en particulier lorsqu’il est associé à d’autres bactéries formant activement des biofilms, telles que Pseudomonas aeruginosa.

Les infections causées par M. luteus peuvent varier en termes de gravité et de progression, souvent influencées par les facteurs de défense de l’hôte. Les symptômes se manifestent généralement sous forme d’inflammation localisée de la région colonisée, avec de très rares cas entraînant une infection systémique, telle qu’une infection sanguine.

Les enquêtes épidémiologiques sur M. luteus doivent être proactives afin d’identifier le statut réel de l’organisme par rapport à l’hôte patient, qu'il s’agisse d’un contaminant, d’un colonisateur ou d’un agent pathogène infectieux. En tant qu’organisme commensal commun, M. luteus peut être présent en permanence dans les échantillons cliniques et être exposé à plusieurs cycles de traitement antibiotique, ce qui nécessite la prise de mesures appropriées pour empêcher le développement de souches résistantes aux antibiotiques.

Pertinence du pathogène pour la transmission en endoscopie

  • Gastroentérologie : Non pertinent

  • Pneumologie : Basse

  • Oto-rhino-laryngologie : Non pertinent

  • Urologie : Basse

Pertinence pour le traitement des endoscopes

  • Organisme peu préoccupant (des niveaux élevés de Micrococcus luteus sont souvent révélateurs de la propreté de l’environnement ou de lacunes dans la manipulation, le séchage et le stockage des endoscopes.)

Mode de transmission

Micrococcus luteus peut être isolé dans le sol, l’eau, la peau des animaux, le complexe nasopharyngé humain, les matières végétales, les aliments et la poussière [1][4].

La transmission se fait généralement par contact direct peau à peau avec des personnes colonisées, ou par le biais de réservoirs présents dans le sol, l’air, l’eau, les surfaces de comptoir, etc. contaminés. [2][4].

Le risque de transmission lors d’une endoscopie est influencé par des erreurs dans la manipulation et/ou le séchage et le stockage de l’endoscope.

Les cas de transmission ne sont pas toujours certains et bien documentés sans nécessiter des tests de laboratoire intensifs et parfois des prélèvements inconfortables sur le patient. Cela s’explique par le fait que les microcoques sont généralement non pathogènes et qu’ils colonisent leurs hôtes humains dans le cadre d’une relation commensale et mutuellement bénéfique. En raison de cette relation, la présence de M. luteus peut fausser les enquêtes épidémiologiques en conduisant à une identification erronée de M. luteus comme contaminant ou agent pathogène sans évaluation appropriée.

Résistance aux antibiotiques

En raison de la faible virulence et du faible taux d’incidence pathogène rapportés pour Micrococcus luteus, les connaissances sur la résistance aux antibiotiques connue de M. luteus sont très limitées. Les recommandations concernant cette espèce sont également limitées en raison de sa faible incidence, mais quelques études de cas ont rapporté des résultats positifs dans l’identification des sensibilités à l’aide de perfusions sur disque de Kirby-Bauer et d’analyses MALDI-TOF [3][4].

Sources et lectures complémentaires

  1. Becker K, von Eiff C. Staphylococcus, Micrococcus, and Other Catalase-positive Cocci. In: Versalovic J, Carroll KC, Funke G, Jorgensen JH, Landry ML, Warnock DW, editors. Manual of Clinical Microbiology, 10th ed. Washington, D.C.: ASM Press, 2011.

  2. Zhu M, Zhu Q, Yang Z, Liang Z. Clinical Characteristics of Patients with Micrococcus luteus Bloodstream Infection in a Chinese Tertiary-Care Hospital. Pol J Microbiol. 2021 Sep;70(3):321-326. doi: 10.33073/pjm-2021-030. Epub 2021 Sep 17. PMID: 34584526; PMCID: PMC8459002.

  3. Young M, Artsatbanov V, Beller HR, Chandra G, Chater KF, Dover LG, Goh EB, Kahan T, Kaprelyants AS, Kyrpides N, Lapidus A, Lowry SR, Lykidis A, Mahillon J, Markowitz V, Mavromatis K, Mukamolova GV, Oren A, Rokem JS, Smith MC, Young DI, Greenblatt CL (2010). "Genome sequence of the Fleming strain of Micrococcus luteus, a simple free-living actinobacterium". Journal of Bacteriology. 192 (3): 841–860. doi:10.1128/JB.01254-09. PMC 2812450. PMID 19948807.

  4. Madigan M; Martinko J, eds. (2005). Brock Biology of Microorganisms (11th ed.). Prentice Hall. ISBN 978-0-13-144329-7.