Comprendre les différences du prélèvement et de la mise en culture des endoscopes : pourquoi nous devons adopter une approche standardisée

Que sont le prélèvement et la mise en culture ?

Le prélèvement et la mise en culture microbiologiques constituent une technique de test de surveillance en plusieurs étapes utilisée pour empêcher la transmission des agents infectieux par le biais de l'endoscopie [1]. Le processus comprend le prélèvement dans les canaux et sur les surfaces critiques de l'endoscope comme l'extrémité distale des duodénoscopes, puis la mise en culture des prélèvements réalisés afin de détecter toute contamination restée présente après le traitement [2].

Pourquoi est-il important d'effectuer le prélèvement et la mise en culture pour la prévention et la lutte contre les infections ?

Une infection peut survenir chez les patients après une endoscopie (infection endogène provoquée par la translocation des bactéries du patient vers d'autres sites au niveau de son corps) ou en raison de la contraction de l'infection suite à l'utilisation de dispositifs médicaux contaminés (infection exogène). Dans ce dernier cas, tout écart par rapport au mode d'emploi ou aux protocoles de traitement recommandés par le fabricant peut être la cause.

Lorsqu'un programme de prélèvement et de mise en culture précoce est mis en place dans un établissement médical, les erreurs de traitement peuvent être évitées afin de réduire au maximum les risques associés au traitement des dispositifs médicaux réutilisables [4]. En outre, lorsque les données obtenues par le prélèvement et la mise en culture des endoscopes sont utilisées à leur plein potentiel, elles peuvent apporter des informations sur les éventuelles défaillances des dispositifs, du matériel (comme les laveurs-désinfecteurs [LD]) ou de l'environnement (comme la qualité de l'eau), et donner lieu à une formation complémentaire du personnel [3]. Il est important toutefois de se rappeler que l'approche de recueil des prélèvements doit être efficace afin de garantir la détection effective de la contamination microbienne des canaux d'endoscope prêts à être utilisés sur les patients [3].

Directives en vigueur en Europe

Les directives conjointes de l'European Society of Gastrointestinal Endoscopy (ESGE) et de l'European Society of Gastroenterology Nurses and Associates (ESGENA) de 2007 recommandent la mise en place d'un programme d'assurance qualité incluant la surveillance microbiologique régulière dans tous les établissements cliniques, et ce pour répondre au devoir de diligence aux patients. Un intervalle de trois mois entre les tests de routine est recommandé [1].

Différences entre les méthodes de prélèvement et mise en culture

Même si le prélèvement et la mise en culture des endoscopes est une pratique courante dans de nombreux pays, les directives et lois nationales en matière d'hygiène et de lutte contre les infections varient en fonction de données historiques régionales/nationales (voir le tableau ci-dessous). Par conséquent, une norme de base relative au prélèvement et à la mise en culture pourrait favoriser l'atténuation du risque d'infection et faciliter la comparaison des résultats entre les pays [3].

Exemples de différences entre les pratiques de prélèvement et de mise en culture des pays

Pays du prélèvement

Pays-Bas [5]

France [6][7]

États-Unis [2]

Australie [8]

Liquide de prélèvement

Solution saline stérile

Agent neutralisant

Eau DI ou OI

Eau stérile ou solution saline

Canaux

Canal d'aspiration/opérateur

Tous les canaux

Canal opérateur (duodénoscopes uniquement)

Tous les canaux

Méthode de prélèvement des canaux

FB

F ou FSF

FBF

FBF ou F

Méthode de prélèvement des extrémités distales

Écouvillon

FBF

Écouvillon ou FBF

F

Agent neutralisant

Non

Oui

Oui

Non

Prélèvement

Séparé

Combiné

Combiné

Combiné

Mise en culture

Pays-Bas [5]

France [6][7]

États-Unis [2]

Australie [8]

Méthode de labo

Filtration sur membrane (0.45µm)

Filtration sur membrane

Filtration ou centrifugation du prélèvement en entier

Centrifugation du prélèvement combiné de 1 ml en entier

Plaques de gélose

Sang, R2A

PCA ou TSA

Sang

Sang, MacConkey

Conditions d'incubation

35°C pendant 72h

30°C jusqu'à 5 jours

35-37°C pendant 72h

- 35°C pendant 48h jusqu'à 5 jours

- 28°C pendant 48h jusqu'à 5 jours

DI=déionisée ; OI=osmose inverse ; F=flush (irrigation) ; FB=flush & brush (irrigation et écouvillonnage) ; FBF=flush & brush & flush (irrigation, écouvillonnage puis irrigation) ; FSF=flush-suction-flush (irrigation, aspiration, irrigation) ; R2A=Reasoner´s 2A agar (gélose R2A) ; PCA=plate count agar (gélose pour dénombrement sur plaque) ; TSA=trypticase soy agar (gélose de soja Trypticase)

Pourquoi est-il important d'adopter une approche standardisée ?

Lors des dix dernières années, des études sur la transmission des pathogènes des endoscopes aux patients ont apporté des preuves et des informations dans l'intérêt de meilleures pratiques [4]. Toutefois, les différences existant entre les méthodes de prélèvement et de mise en culture rendent difficile la comparaison des données générées dans les situations d'épidémie et la détermination des principes fondamentaux et primordiaux associés [3].

La création d'une norme standardisée permettrait de comparer les résultats et les niveaux de contamination entre les pays. Cela favoriserait l'établissement d'un point de référence global pour la norme de soins et la sécurité des patients, ainsi que l'optimisation des résultats pour les patients.

Pour en savoir plus à propos de la mise en œuvre et de la gestion d'un programme de prélèvement et de mise en culture des endoscopes, d'autres publications d'Olympus sont disponibles, comme le livre blanc sur la mise en œuvre pratique d'un programme de prélèvement et de mise en culture : Consejos, trucos y enfoques para el muestreo y cultivo de endoscopios.

Sources et lectures complémentaires

  1. Beilenhoff U, Neumann CS, Rey JF, Biering, et al. ESGE-ESGENA guideline for quality assurance in reprocessing: microbiological surveillance testing in endoscopy. Endoscopy. 2007;39(2):175-81.

  2. FDA/CDC/ASM. Duodenoscope Surveillance Sampling and Culturing. Reducing the Risks of Infection. Disponible sur : https://www.fda.gov/media/111081/download. Consulté en septembre 2022.

  3. Alfa, M., & Singh, H. Contaminated flexible endoscopes: Review of impact of channel sampling methods on culture results and recommendations for root-cause analysis. Infection Control & Hospital Epidemiology. 2022;43(5):623-638.

  4. Olympus. Tips, Tricks and Insights for Implementation and Management of an Endoscope Sampling and Culturing Program. Disponible sur : https://infectionprevention.olympus.com/en-us/scientific-evidence/publications/sampling-and-culturing. Consulté en décembre 2022.

  5. Rauwers, A. W., Voor In 't Holt, A. F., Buijs, J. G., et al. High prevalence rate of digestive tract bacteria in duodenoscopes: a nationwide study. Gut. 2018;67(9):1637–1645.

  6. INSTRUCTION N° DGOS/PF2/DGS/VVS1/PP3/2018/195 du 2 août 2018 relative à l’actualisation du traitement des endoscopes souples thermosensibles à canaux de type duodénoscope au sein des structures de soins. Disponible sur : INSTRUCTION N°. DGOS/PF2/DGS/VVS1/PP3/2018/195 du 2 août 2018 relative à l’actualisation du traitement des endoscopes souples thermosensibles à canaux de type duodénoscope au sein des structures de soins - Légifrance (legifrance.gouv.fr). Consulté en septembre 2022.

  7. Ministere des Affaires Sociales et de la Sante: Guide Technique. Traitement des endoscopes souples thermosensibles a canaux. 2016. Disponible sur : https://www.preventioninfection.fr/document/guide-technique-traitement-des-endoscopes-souples-thermosensibles-a-canaux/. Consulté en décembre 2022.

  8. Gastroenterological Society of Australia (GESA): Clinical Update - Infection Prevention and Control in Endoscopy 2021. Disponible sur : https://www.genca.org/public/5/files/Nurses%20info/IPCE%202021_Feb2022update.pdf Consulté en décembre 2022.