Résistance aux antimicrobiens (RAM)
Introduction
La résistance aux antimicrobiens (RAM) est devenue une préoccupation de plus en plus critique dans les environnements médicaux du monde entier depuis 2019. L’usage abusif généralisé des antibiotiques, ainsi qu’une stagnation dans le développement de nouveaux agents antimicrobiens, a fortement contribué à l’augmentation des organismes multirésistants (MDR) [1]. De plus, l’échange de mécanismes de résistance sophistiqués entre les pathogènes a considérablement limité les options de traitement 6. Afin de soutenir les professionnels de santé (PDS) dans le développement de stratégies efficaces de test de sensibilité aux antibiotiques (AST) et de séquençage du génome (WGS), les tableaux A et B présentent des données récentes [1][2][3] sur les tendances de RAM dans les systèmes hospitaliers, en mettant l’accent sur la surveillance microbienne des endoscopes gastro-intestinaux (GI) et l’environnement de soins.
Tableau A : Mise au point sur les RAM émergents en endoscopie GI*
Organisme hautement préoccupant | Réservoir | Pertinence pour le S&C des endoscopes | Prevelance rates |
|---|---|---|---|
Eschericha coli | Colonisateur naturel du tractus GI humain, souvent retrouvé au niveau de sorties d’eau (p. ex., robinets et canalisations). | Peut indiquer des lacunes dans le nettoyage ou la désinfection manuels, ou des dommages au dispositif. | CPRE : élevé Tube digestif supérieur (non CPRE) : moyenne Tube digestif inférieur : faible |
Klebsiella pneumoniae | Colonisateur naturel du tractus GI humain, rarement retrouvé sur des surfaces inertes. | Peut indiquer des lacunes dans le nettoyage ou la désinfection manuels, ou des dommages au dispositif. | CPRE : élevé Tube digestif supérieur (non CPRE) : moyenne Tube digestif inférieur : faible |
Pseudomonas aeruginosa | Souvent retrouvé dans l’eau ou sur les surfaces inertes et les fomites (p. ex., canalisations, barrières de lits, éviers), peut parfois coloniser le tractus GI humain. | Peut indiquer une contamination de l’eau ou des lacunes dans la désinfection, le séchage, ou le stockage et la manipulation. | CPRE : moyenne Tube digestif supérieur (non CPRE) : moyenne Tube digestif inférieur : faible |
Acinetobacter baumanii | Peau, surfaces et fomites. Colonise très souvent les surfaces en milieu hospitalier. Rarement retrouvé dans le tractus GI humain. | Peut indiquer des défauts dans le stockage ou le séchage, ou une contamination du prélèvement. | CPRE : moyenne Tube digestif supérieur (non CPRE) : moyenne Tube digestif inférieur : faible |
*Données de 2022
Tableau B : Les RAM se développant rapidement en milieu hospitalier
Organisme | Résistance | Pertinence pour le S&C des endoscopes | Réservoir |
|---|---|---|---|
Enterobacterales | Résistance aux carbapénèmes et production de bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) | Peut indiquer des lacunes dans le nettoyage ou la désinfection manuels, ou des dommages au dispositif. | Les Enterobacterales constituent un vaste groupe de bactéries présentes dans l’eau, le sol et les surfaces environnementales. Des échantillons cliniques ont permis d’isoler des Enterobacterales dans le nasopharynx, la peau, les muqueuses et le tractus GI. |
Acinetobacter spp. (En particulier A. baumanii) | Résistance aux carbapénèmes | Peut indiquer des défauts dans le stockage ou le séchage, ou une contamination du prélèvement. | Peau, surfaces et fomites. Colonise très souvent les surfaces en milieu hospitalier. Rarement retrouvé dans le tractus GI humain. |
Candidozyma (Candida) auris | Multirésistance (MDR) | Peut indiquer des lacunes dans le nettoyage ou la désinfection manuels, ou des dommages au dispositif. Les Candida spp. ont également été rarement retrouvés dans les systèmes d’approvisionnement en eau des hôpitaux. | Les Candidozyma (Candida) auris peuvent se retrouver dans l’eau et sur le sol. Le Candida est également un organisme commensal commun présent sur la peau, dans le tractus GI et dans l’appareil génital féminin. |
Staphylococcus aureus | Résistance à la méthicilline | Peut indiquer des défauts dans le stockage ou le séchage, ou une contamination du prélèvement. | Peau, surfaces et fomites. Colonise très souvent les surfaces en milieu hospitalier. Rarement retrouvé dans le tractus GI humain. |
Enterococcus spp. | Résistance à la vancomycine | Peut indiquer des lacunes dans le séchage, la manipulation et/ou le stockage de l’endoscope. Lacunes possibles dans le nettoyage manuel ou éventuels dommages au dispositif. | Les Enterococci colonisent largement les tractus GI et biliaires, et dans une moindre mesure la peau, la cavité buccale, l’aine et les voies génitales. Ils peuvent également se retrouver dans l’eau et sur le sol. |
Pseudomonas aeruginosa | Multirésistance (MDR) | Peut indiquer une contamination de l’eau ou des lacunes dans la désinfection, le séchage, ou le stockage et la manipulation. | Souvent retrouvé dans l’eau ou sur les surfaces inertes et les fomites (p. ex., canalisations, barrières de lits, éviers), peut parfois coloniser le tractus GI humain. |
Le rôle de la surveillance microbienne
Le prélèvement et la mise en culture restent la référence absolue pour évaluer le profil microbien des endoscopes flexibles. Les isolats purs obtenus à partir d’échantillons cultivés peuvent être analysés pour l’AST et le WGS, ce qui permet une identification précise des profils de résistance. Les spécialistes en prévention des infections peuvent utiliser le tableau A pour évaluer quels types de procédures GI et leurs endoscopes associés présentent un risque plus élevé de contamination ou de transmission de RAM. Ces informations permettent de mener des enquêtes épidémiologiques ciblées et de prendre des décisions éclairées en matière de gestion des antibiotiques.
Réservoirs environnementaux et formation de biofilm
Les micro-organismes pathogènes récupérés à partir d’échantillons cliniques proviennent souvent de sources environnementales telles que l’eau, les surfaces et les sols. Les dispositifs médicaux, notamment les endoscopes, peuvent être des vecteurs de transmission. La capacité des bactéries comme Pseudomonas et Acinetobacter à produire du biofilm les aide à survivre dans des conditions difficiles, notamment l’exposition aux détergents, aux désinfectants, à la dessiccation et aux températures extrêmes. Le biofilm protège les microbes, ce qui leur permet de survivre, d’échanger leur matériel génétique et de se propager. Il est essentiel d’identifier l’origine des bactéries pour orienter les efforts de décontamination et comprendre les lacunes potentielles dans les pratiques de traitement. Le tableau B résume les mécanismes de résistance et les réservoirs habituels en se basant sur le « Antimicrobial Threats Report » 2022 du CDC [4][5]. Les spécialistes en prévention des infections peuvent tirer parti de ces informations pour corriger les protocoles de nettoyage et de désinfection dans les unités d’endoscopie et améliorer les audits dans les zones de traitement.
Sources et lectures complémentaires
Antimicrobial Resistance Collaborators. “Global burden of bacterial antimicrobial resistance in 2019: a systematic analysis.” Lancet (London, England) vol. 399,10325 (2022): 629-655. doi:10.1016/S0140-6736(21)02724-0.
Deb, Anasua et al. “Gastrointestinal Endoscopy-Associated Infections: Update on an Emerging Issue.” Digestive diseases and sciences vol. 67,5 (2022): 1718-1732. doi:10.1007/s10620-022-07441-8.
Balan, Gheorghe G et al. “Duodenoscope-associated infections: a review.” European journal of clinical microbiology & infectious diseases: official publication of the European Society of Clinical Microbiology vol. 38,12 (2019): 2205-2213. doi:10.1007/s10096-019-03671-3.
CDC. “Antimicrobial Resistance Threats in the United States, 2021-2022.” Antimicrobial Resistance, 16 July 2024, www.cdc.gov/antimicrobial-resistance/data-research/threats/update-2022.html. Consulté en janvier 2026.
CDC. “Antimicrobial Resistance Facts and Stats.” Antimicrobial Resistance, 22 Apr. 2024, www.cdc.gov/antimicrobial-resistance/data-research/facts-stats/index.html. Consulté en janvier 2026.
Peri AM et al. Antimicrobial treatment challenges in the era of carbapenem resistance. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease vol 94, 4 (2019): 413-425. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2019.01.020. Consulté en janvier 2026.